Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Top2aQ01320 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top2aQ01320 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms