Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EgfrQ01279 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EgfrQ01279 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms