Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gjb2Q00977 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms