Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms