Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shc1P98083 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shc1P98083 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shc1P98083 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shc1P98083 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shc1P98083 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shc1P98083 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shc1P98083 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shc1P98083 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shc1P98083 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shc1P98083 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms