Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bop1P97452 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bop1P97452 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bop1P97452 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bop1P97452 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bop1P97452 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms