Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smyd1P97443 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smyd1P97443 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms