Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim43bP86448 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim43bP86448 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms