Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irf3P70671 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irf3P70671 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irf3P70671 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms