Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tp53bp1P70399 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms