Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msx3P70354 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msx3P70354 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msx3P70354 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms