Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad1P70340 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms