Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stra8P70278 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Stra8P70278 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra8P70278 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra8P70278 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra8P70278 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stra8P70278 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stra8P70278 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms