Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd13P70217 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms