Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb4bP68372 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb4bP68372 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms