Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps17P63276 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps17P63276 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps17P63276 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms