Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr2lP62876 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr2lP62876 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms