Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vsnl1P62761 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms