Protein–RNA interactions for Protein: P62257

Ube2h, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2hP62257 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2hP62257 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube2hP62257 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms