Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vbp1P61759 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vbp1P61759 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vbp1P61759 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vbp1P61759 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vbp1P61759 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vbp1P61759 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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