Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg6P61406 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg6P61406 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg6P61406 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg6P61406 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smg6P61406 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg6P61406 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg6P61406 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smg6P61406 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg6P61406 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms