Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actr1aP61164 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actr1aP61164 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms