Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PlnP61014 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PlnP61014 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PlnP61014 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PlnP61014 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PlnP61014 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PlnP61014 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PlnP61014 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PlnP61014 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms