Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif4a1P60843 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif4a1P60843 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms