Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ActbP60710 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ActbP60710 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ActbP60710 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ActbP60710 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ActbP60710 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ActbP60710 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ActbP60710 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ActbP60710 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ActbP60710 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ActbP60710 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ActbP60710 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ActbP60710 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ActbP60710 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ActbP60710 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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