Protein–RNA interactions for Protein: P59999

Arpc4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc4P59999 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc4P59999 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc4P59999 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc4P59999 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arpc4P59999 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc4P59999 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc4P59999 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc4P59999 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc4P59999 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc4P59999 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc4P59999 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arpc4P59999 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arpc4P59999 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms