Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rin3P59729 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms