Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp4P59240 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphp4P59240 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp4P59240 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms