Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strn4P58404 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Strn4P58404 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Strn4P58404 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn4P58404 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn4P58404 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn4P58404 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn4P58404 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Strn4P58404 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms