Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcbp4P57724 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcbp4P57724 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms