Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn18P56857 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms