Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bace1P56818 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms