Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rp1P56716 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rp1P56716 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rp1P56716 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms