Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctbp2P56546 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctbp2P56546 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms