Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5bP56480 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5bP56480 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms