Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp5P56399 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp5P56399 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp5P56399 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms