Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Sh3bp1P55194 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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