Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Aqp4P55088 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aqp4P55088 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aqp4P55088 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aqp4P55088 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aqp4P55088 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aqp4P55088 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aqp4P55088 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aqp4P55088 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aqp4P55088 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aqp4P55088 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aqp4P55088 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms