Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acod1P54987 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acod1P54987 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acod1P54987 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms