Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ephb3P54754 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ephb3P54754 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms