Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PctpP53808 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PctpP53808 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PctpP53808 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PctpP53808 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PctpP53808 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PctpP53808 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PctpP53808 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PctpP53808 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PctpP53808 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PctpP53808 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PctpP53808 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PctpP53808 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PctpP53808 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PctpP53808 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PctpP53808 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms