Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Map3k1P53349 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Map3k1P53349 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Map3k1P53349 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms