Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna1P52793 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna1P52793 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms