Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApodP51910 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApodP51910 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApodP51910 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApodP51910 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApodP51910 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApodP51910 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms