Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec1P51908 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apobec1P51908 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms