Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccr4P51680 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms