Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorcP51450 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorcP51450 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RorcP51450 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RorcP51450 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorcP51450 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorcP51450 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorcP51450 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorcP51450 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorcP51450 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorcP51450 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RorcP51450 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RorcP51450 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RorcP51450 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RorcP51450 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms