Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TspoP50637 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TspoP50637 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TspoP50637 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TspoP50637 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TspoP50637 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TspoP50637 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TspoP50637 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TspoP50637 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TspoP50637 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TspoP50637 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TspoP50637 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TspoP50637 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TspoP50637 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TspoP50637 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TspoP50637 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TspoP50637 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TspoP50637 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TspoP50637 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TspoP50637 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TspoP50637 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TspoP50637 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TspoP50637 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TspoP50637 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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