Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pa2g4P50580 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pa2g4P50580 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms