Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VdrP48281 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VdrP48281 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VdrP48281 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VdrP48281 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms